निधिवन में रास और रंगमहल के अलावा भी एक और रहस्य है जिसके बारे में कोई भी ठीक ठीक नहीं बता सकता. ये रहस्य है यहाँ के पेड़ों का .
आम तौर पर जहाँ पेड़ों की शाखाएं ऊपर की ओर बढती है वहीँ निधिवन के पेड़ों की शाखाएं जमीन की ओर बढती है. शाखाएं इस प्रकार बढ़ जाती है कि रास्ता बनाने के लिए बांस के खम्बों के सहारे शाखाओं को ऊपर रखना पड़ता है. निधिवन में लगे वृक्षों और तुलसी के पौधों को कोई नुक्सान भी नहीं पहुंचाता है. कहा जाता है जो भी कोई इन पौधों को नुक्सान पहुंचाता है या फिर शाखा तोड़कर घर ले जाता है तो उस पर विपदा आ जाती है.